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蛋白分子量
1.凝胶电泳
2.尺寸排阻柱
3.质谱

蛋白样品纯度
1.凝胶电泳
2.Western blot
3.高效液相色谱（HPLC）

蛋白稳定性
1.蛋白质展开的自由能变化△G，蛋白在液体中介于展开和折叠状态间的平衡常数。 这两个参数可以评估蛋白对变性条件的承受能力，比如温度、尿素浓度。也可以用来比价两个蛋白的稳定性。我们称它为绝对稳定性。
2.在实际条件下的蛋白质的稳定性。 在一定条件下，蛋白质的结构和功能随时间的变化而变化。它决定了一个活性蛋白质的半衰期。我们称它为相对稳定性。

蛋白质聚合（一些蛋白形成低聚合物但是仍然是溶解的。因此这种聚合是肉眼不可见的）
1.尺寸排阻色谱仪
2.动态光散射（DLS）

圆二色谱测定蛋白质结构（CD）
圆二色谱是一种测定蛋白质结构的常用方法。它可以测定：
1.二级结构，特别是蛋白质中的α-螺旋结构的含量
2.蛋白质是否是被展开的
3.蛋白质的稳定性

蛋白质-配体结合和蛋白质-受体结合
我们的主要方法是荧光，包括荧光强度和荧光偏振（极化）。